На странице Налогово-таможенного департамента есть подробные разъяснения условий применения этого порядка (на эстонском языке):

https://www.emta.ee/ariklient/maksud-ja-tasumine/kaibemaks/kaupade-maksustamine/kauba-voi-pohivara-impordi-kaibemaksu-kmd-l-deklareerimine